在双样本MR研究中，遗传变异-危险因素关联和遗传变异-结局关联来自彼此独立的两个研究人群。一个研究人群提供基因型和暴露因素数据，另一个研究人群提供基因型和结局数据。通常情况下可以利用已有的独立数据集，如GWAS数据去扩大样本量以提高统计效能。但在使用双样本时来自不同人群的数据可能存在异质性，导致结果的外部效度降低，同时，不同人群之间的数据整合可能面临基因型差异、环境差异等问题，需要进行额外的处理。