大部分酶和药物活性都需要依赖蛋白质和小分子之间的相互作用,因此,准确预测这些相互作用是推动药物研发和生物技术发展的关键。然而,目前存在的机器学习模型在处理未知蛋白质时,其泛化能力往往受到限制。这可能是由于在数据表示生成过程中,蛋白质与小分子之间的信息交互未能得到充分捕捉。
为了攻克这一难题,德国的研究团队研发了名为ProSmith的机器学习框架。该框架运用多模态Transformer网络,能够同步处理并整合蛋白质的氨基酸序列和小分子的字符串信息。这一方法确保在计算两者的数字化表示时,两类分子间的所有相关信息都能实现充分交互,从而使模型能更精准地考量它们的结构和功能交互。实验结果显示,在预测激酶抑制、推断酶的可能底物等多项任务中,模型都具有较好的预测效果。
来自加拿大的研究团队设计了机器学习模型,可以对纳米药物的治疗效果进行预测,为纳米药物的开发和优化提供了新的方法和思路,有望加速纳米药物的研发进程,提高药物递送的效率和效果。